Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssuh2Q8C3L1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssuh2Q8C3L1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms