Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBR3Q6ZT12 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBR3Q6ZT12 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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