Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Usp39Q3TIX9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms