Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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GEN1Q17RS7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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GEN1Q17RS7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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GEN1Q17RS7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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GEN1Q17RS7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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GEN1Q17RS7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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GEN1Q17RS7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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GEN1Q17RS7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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