Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r181Q0P547 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r181Q0P547 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r181Q0P547 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r181Q0P547 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r181Q0P547 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r181Q0P547 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r181Q0P547 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r181Q0P547 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r181Q0P547 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r181Q0P547 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms