Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grin2cQ01098 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms