Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TgfbiP82198 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TgfbiP82198 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms