Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC5P78333 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC5P78333 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC5P78333 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC5P78333 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC5P78333 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC5P78333 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC5P78333 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC5P78333 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC5P78333 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC5P78333 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC5P78333 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC5P78333 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC5P78333 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC5P78333 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC5P78333 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC5P78333 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms