Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Defa3P28310 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defa3P28310 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms