Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpbP27790 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CenpbP27790 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CenpbP27790 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms