Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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SftpcP21841 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SftpcP21841 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SftpcP21841 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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SftpcP21841 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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