Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Csn1s1P19228 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Csn1s1P19228 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn1s1P19228 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms