Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl20O89093 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl20O89093 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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