Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIP1O00291 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIP1O00291 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HIP1O00291 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIP1O00291 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIP1O00291 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIP1O00291 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIP1O00291 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIP1O00291 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIP1O00291 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIP1O00291 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIP1O00291 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms