Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm20939L7N243 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm20939L7N243 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm20939L7N243 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm20939L7N243 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm20939L7N243 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm20939L7N243 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20939L7N243 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20939L7N243 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20939L7N243 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20939L7N243 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20939L7N243 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20939L7N243 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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