Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc179J3QM76 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms