Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nccrp1G3X9C2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nccrp1G3X9C2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms