Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcdh9F8VPK8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcdh9F8VPK8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms