Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl3lE9PWZ3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl3lE9PWZ3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms