Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM89A2RUT3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms