Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Pikfyve-202ENSMUST00000097707 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 4930555G01Rik-201ENSMUST00000112770 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm3099-201ENSMUST00000112787 2065 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Atf7-203ENSMUST00000169033 2165 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm24327-201ENSMUST00000175108 78 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm45515-201ENSMUST00000210796 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Fgf13-202ENSMUST00000119306 2091 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sox12Q04890 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gucy1b3-204ENSMUST00000193597 3171 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm9776-201ENSMUST00000059598 2980 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Pacsin2-202ENSMUST00000165095 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Zfp74-201ENSMUST00000032797 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sox12Q04890 AC156025.3-201ENSMUST00000225919 3095 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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