Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Taf8Q9EQH4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Taf8Q9EQH4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms