Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl40Q9D783 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl40Q9D783 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl40Q9D783 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl40Q9D783 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl40Q9D783 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl40Q9D783 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl40Q9D783 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Klhl40Q9D783 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl40Q9D783 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms