Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl22Q99JN2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl22Q99JN2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms