Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg16l1Q8C0J2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms