Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ckap2lQ7TS74 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ckap2lQ7TS74 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms