Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NinlQ6ZQ12 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NinlQ6ZQ12 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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