Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CYP26C1Q6V0L0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP26C1Q6V0L0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms