Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Zeb1Q64318 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Zeb1Q64318 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Zeb1Q64318 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms