Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtp3Q5QGU6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms