Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra8P70278 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra8P70278 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra8P70278 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra8P70278 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra8P70278 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stra8P70278 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stra8P70278 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms