Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tuba4aP68368 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba4aP68368 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms