Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab6aP35279 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab6aP35279 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms