Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gsx1P31315 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gsx1P31315 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gsx1P31315 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gsx1P31315 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gsx1P31315 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gsx1P31315 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gsx1P31315 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gsx1P31315 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gsx1P31315 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gsx1P31315 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gsx1P31315 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gsx1P31315 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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