Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RxrgP28705 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RxrgP28705 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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