Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P04212 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P04212 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P04212 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P04212 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P04212 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
P04212 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
P04212 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
P04212 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
P04212 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
P04212 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
P04212 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
P04212 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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