Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capns1O88456 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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