Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm6871L7N248 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm6871L7N248 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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