Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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