Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930467E23RikD3Z1P8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930467E23RikD3Z1P8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms