Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Btg1-201ENSMUST00000038377 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm8540-201ENSMUST00000168952 732 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm42605-201ENSMUST00000199565 385 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm44267-201ENSMUST00000204132 385 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 CU074400.1-201ENSMUST00000224411 220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Arhgap24-201ENSMUST00000070000 3632 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 1700020I14Rik-202ENSMUST00000153581 8300 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm28177-201ENSMUST00000185516 3532 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Def8-205ENSMUST00000108832 3242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Def8-201ENSMUST00000001522 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm15066-201ENSMUST00000120163 2608 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Abca8a-202ENSMUST00000100287 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Dhrs7b-202ENSMUST00000108718 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Nup210l-201ENSMUST00000029548 5681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Tdrd5-204ENSMUST00000167528 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Trappc12-202ENSMUST00000168129 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Pnmal1-201ENSMUST00000038163 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Filip1-201ENSMUST00000093811 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Arap1-203ENSMUST00000098243 3693 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Ubap2l-220ENSMUST00000199834 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Dhx30-203ENSMUST00000165596 3726 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm1070-201ENSMUST00000114185 2874 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Clca2-201ENSMUST00000040465 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Zfp638-201ENSMUST00000032088 6199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm45718-201ENSMUST00000207577 3794 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Serinc4-201ENSMUST00000056312 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Zfp248-201ENSMUST00000069292 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Baalc-201ENSMUST00000163313 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm3238W4VSP7 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms