Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mbd3Q9Z2D8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms