Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCNB1IP1Q9NPC3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms