Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gkap1Q9JMB0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gkap1Q9JMB0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms