Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin3Q9JLB9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin3Q9JLB9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nectin3Q9JLB9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Nectin3Q9JLB9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Nectin3Q9JLB9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nectin3Q9JLB9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nectin3Q9JLB9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nectin3Q9JLB9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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