Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm20Q9DCC8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm20Q9DCC8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm20Q9DCC8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm20Q9DCC8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm20Q9DCC8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm20Q9DCC8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm20Q9DCC8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tomm20Q9DCC8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tomm20Q9DCC8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tomm20Q9DCC8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20Q9DCC8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms