Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Batf3Q9D275 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Batf3Q9D275 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms