Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pfdn1Q9CWM4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pfdn1Q9CWM4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pfdn1Q9CWM4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pfdn1Q9CWM4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pfdn1Q9CWM4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfdn1Q9CWM4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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