Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
4930535I16RikQ9CUI2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms