Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
NLRP1Q9C000 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms